Ba loại vector chuyển gen cơ bản bao gồm: 1) Plasmid: Là các phân tử DNA nhỏ tồn tại độc lập trong tế bào vi khuẩn. Chúng có khả năng tự sao chép và mang được các gen cần chuyển. 2) Phage/Phagemid: Là các vecto chuyển gen được tạo từ vi khuẩn nhiễm sắc thể (phage) hoặc kết hợp giữa plasmid và phage (phagemid). Chúng cũng có khả năng tự sao chép và mang được các gen cần chuyển. 3) Nhiễm sắc thể nhân tạo (Artificial chromosome): Bao gồm các loại vector như BAC (Bacterial Artificial Chromosome) và YAC (Yeast Artificial Chromosome). Chúng có khả năng mang được các đoạn trình tự DNA lớn và tồn tại trong tế bào vi sinh vật hoặc thực vật. Đây là ba loại vector chuyển gen cơ bản được sử dụng phổ biến trong công nghệ sinh học.