Thủy chế của sông ngòi là đặc điểm về sự phân bố, chế độ nước và sự biến đổi lưu lượng nước của các con sông, suối trong một khu vực hoặc một lưu vực sông theo thời gian. Nó phản ánh sự thay đổi về lượng nước chảy trong sông ngòi theo mùa, theo năm, do ảnh hưởng của các yếu tố tự nhiên như lượng mưa, nhiệt độ, địa hình, thảm thực vật, cũng như các yếu tố nhân tạo như đập thủy điện, khai thác nước. Nói cách khác, thủy chế của sông ngòi cho biết sông ngòi có nhiều hay ít nước, nước chảy đều hay không đều, có lũ hay hạn hán theo mùa, giúp đánh giá nguồn nước và quản lý tài nguyên nước hiệu quả.