Thông điệp mà tác giả Nguyễn Duy muốn nhắn gửi qua bài thơ “Vườn Cây Của Ba” là sự đối lập giữa sự dễ thương và sự dễ sợ trong cuộc sống. Tác giả so sánh giữa vườn cây của mẹ, với những cây dễ thương như hoa, rau, lúa, và vườn cây của ba, với những cây dễ sợ như cây xù xì, cây có gai. Thông điệp ẩn sau đó là sự đa dạng và phong phú của cuộc sống, không chỉ bao gồm những điều dễ thương mà còn có những khía cạnh khó khăn, gai góc. Tác giả muốn nhấn mạnh rằng, dù cuộc sống có những khía cạnh khó khăn, gian khổ, thách thức, nhưng đó cũng là phần không thể thiếu, tạo nên vẻ đẹp và sức sống đầy màu sắc của cuộc sống. Đó là lý do tại sao tác giả chọn thông điệp này, để khuyến khích bạn đọc nhận biết và trân trọng sự đa dạng, phong phú của cuộc sống, cũng như ý nghĩa sâu sắc đằng sau những thách thức và khó khăn mà chúng ta gặp phải.